不同的水母有不同的形态，水母身体的主要成分是水，其体内含水量一般可达98%以上，并由内外两胚层所组成，两层间有一个很厚的中胶层，不但透明，而且有漂浮作用。其他则是蛋白质和脂质所构成，所以水母的身体呈现透明状。它们没有心脏、血液、鳃和骨骼。普通水母的伞状体不很大，只有20-30厘米长。它们在运动之时，利用体内喷水反射前进，就好像一顶圆伞在水中迅速漂游。

水母的伞状体内有一种特别的腺，可以发出一氧化碳，使伞状体膨胀。水母触手中间的细柄上有一个小球，里面有一粒小小的听石，这是水母的“耳朵”。由海浪和空气磨擦而产生的次声波冲击听石，刺激着周围的神经感受器，使水母在风暴来临之前的十几个小时就能够得到信息，从海面一下子全部消失了。

身体也区分成上伞面及下伞面，无缘膜、伞缘具有一圈触手，不同的种触手的数目不同，触手或实心或空心，或长或短，也有少数种没有触手，例如根口水母类。伞缘具有感觉器官，也称为触手囊，数目为4或4的倍数，海月水母有8个，呈缺刻状，因此将伞缘分成了8片。下伞中央的垂唇末端向外延伸，形成4个或8个口腕，口腕向中心的一侧有沟。

钵水母类伞缘的4个或8个触手囊也是它的神经感觉中心，它具有感光、重力感受及化学感受的功能。触手囊是由环管向外延伸形成一个中空的小盲管，其末端具有内胚层分泌的钙质颗粒，称平衡石（statolith）。外伞缘在平衡囊上端延伸形成笠（hood），用以保护及遮盖下面的平衡囊，其两侧有感觉瓣（sensorylappets），其上有感觉细胞及纤毛。当身体倾斜时，端部的结石与感觉纤毛受到刺激而引起运动以调节身体的平衡。